Bubonic-ruttoa esiintyy yleensä 2-5 päivän kuluttua bakteerien altistumisesta, mutta voi esiintyä muutamasta tunnista 12 päivään. Ne alkavat äkillisesti vilunväristyksillä ja kuumeen ollessa jopa 41 ° C. Sydämen lyönti tulee nopeaksi ja heikoksi ja verenpaine voi laskea. Anus ilmestyy samanaikaisesti tai pian kuumeen jälkeen ja on tavallisesti kivulias palpataatioon.
Yersinia pestis -infektion aiheuttama rutto voi olla buboninen, keuhkokuumeinen, septikeeminen tai vähäinen pestis, ja oireet vaihtelevat rypytyypin mukaan. Saattaa olla levottomuutta, deliriumia, henkistä sekavuutta ja motorisen koordinoinnin menetys. Maksa ja perna voivat lisääntyä tilavuudella.
Yli puolet käsittelemättömistä yksilöistä kuolee kolmannen ja viidennen päivän välillä oireiden puhkeamisen jälkeen.
